Le CILSS est un organisme sous-régional. Il va sans dire que son fonctionnement doit être assuré par les Etats membres et que les donateurs (Etats comme Agences Internationales) assurent le financement de la partie des charges de structure correspondant à la mise en œuvre des projets financés par les bailleurs concernés. De l’objectif de base qui était la lutte contre la sécheresse et la désertification, l’organisation est passée à une multiplication des programmes et des activités. Ainsi ont été créés, avec une sollicitude bienveillante des donateurs, de nouveaux champs d’intervention sans que parallèlement, ait été prévu un renforcement des moyens organisationnels et financiers des centres administratifs principaux. La réussite de certains programmes et activités a constitué pendant les dernières années un encouragement et une justification favorable à leur démultiplication.