La première initiative du CILSS a été le projet « Recherche et Développement de la Lutte Intégrée contre les ennemis des principales cultures vivrières dans les pays du Sahel » communément dénommé Projet lutte intégrée (PLI) que les pays membres ont approuvé lors du Conseil des Ministres tenu à Ouagadougou en avril 1977, adoptant ainsi de fait une politique de lutte intégrée pour le secteur de l’agriculture.
Le Projet 2 du Programme de Renforcement de la Résilience à l’Insécurité Alimentaire et Nutritionnelle au Sahel (P2- P2RS) est une initiative conjointe de la Banque Africaine de Développement (BAD) et du Comité permanent Inter-États de Lutte contre la Sécheresse au Sahel (CILSS) pour mettre en oeuvre un programme innovant de Résilience à travers le développement des chaines de valeur agro-sylvo-pastorales et halieutique afin de valoriser les acquis du Projet 1 (P1- P2RS) surtout en matière d’infrastructures vertes et marchandes. Ainsi, le Projet 2 s’inscrit dans une approche novatrice et régionale couvrant 10 pays membres du CILSS dont les six (6) pays du P1-P2RS et quatre (4) nouveaux pays intégrateurs du programme dont le Bénin, la Guinée Bissau, la Guinée Conakry et le Togo.